多功能氣相色譜儀是以氣體作為流動相，當樣品由微量注射器“注射”進入進樣器后，被載氣攜帶進入填充柱或毛細管色譜柱。由于樣品中各組分在色譜柱中的流動相和固定相間分配或吸附系數(shù)的差異，在載氣的沖洗下，各組分在兩相間作反復多次分配使各組分在柱中得到分離，然后用接在柱后的檢測器根據(jù)組分的物理化學特性將各組分按順序檢測出來。多功能氣相色譜儀就是首先確定樣品預處理方法，然后優(yōu)化分離條件，直至達到滿意的分離結(jié)果。最后，建立數(shù)據(jù)處理方法，包括：定性鑒定和定量鑒定。方法的一般步驟如下：
1、樣品來源及其預處理方法：
GC能直接分析的樣品必須是氣體或液體，固體樣品在分析前應(yīng)當溶解在適當?shù)娜軇┲校疫€要保證樣品中不含GC不能分析的組分（如，無機鹽）或可能會損壞色譜柱的組分。
2、確定儀器配置：
所謂儀器配制就是用于分析樣品的方法所采用的進樣裝置、載氣、色譜柱以及檢測器。
3、確定初始操作條件：
當樣品準備好，且儀器配制確定之后，就可開始進行嘗試性分離。
進樣量要根據(jù)樣品濃度、色譜柱容量、檢測器靈敏度來確定。色譜柱溫度的確定主要由樣品的復雜程度和氣化溫度決定。
檢測器的溫度是指檢測器加熱塊溫度，而不是實際監(jiān)測點（如，火焰）的溫度。
